科技信息研究所是新疆农垦科学院下属的综台性农业信息科研服务机构，其前身是院科技情报所，经过发展，于2002年5月更名为科技信息研究所。主要从事科技期刊出版编辑（《新疆农垦科技》、《绿洲农业科学与工程》）、科技咨询服务、农业信息技术开发、网络信息服务、图书文献资源服务等工作。

下设科技期刊编辑部、农业产业发展研究室、科技信息服务研究室3个部门。现共有专业技术人员13人，其中正高3人、副高5人、中级3人。

现拥有院农业信息技术实验室、国家农业信息化工程技术研究中心---新疆工作站、国家农业科学数据共享中心兵团共享服务分中心等3个科研平台。

《新疆农垦科技》荣获全国“百强科技期刊”称号（2018年），《新疆农垦科技》和《绿洲农业科学与工程》获得中国期刊协会授予的“中国精品期刊展”荣誉（2021年、2022年）。“兵团现代农业科技创新研究智库”获得兵团科技局的认定，承接的发展规划、咨询报告等多项研究成果获得上级部门采纳应用。开发建成了兵团农产品标准数据库、兵团二级文献库、新疆现代农业信息整合服务平台、跨区域科技资源整合服务平台、PAID 6.0专家系统开发平台等多个信息平台。先后承担、参加国家科技支撑计划“跨区域科技资源整合服务平台”、第三次新疆综合科学考察等国家级、兵团级各类项目10余项，获软件著作权14件。