新疆农垦科学院生物技术研究所，系2007年5月成立的新疆农垦科学院分子农业技术育种中心于2014年8月更名而成。下设花生种质资源与育种应用创新团队、食用菌课题组，果蔬授粉与绿色防控课题组。现有专业技术人员11人，研究员3人、副研究员4人、中级职称4人，博士5人，其中自治区油料产业技术体系花生岗位专家1人。现有科研平台2个，分别为国家农作物种质资源库兵团分库和作物种质创新与基因资源利用兵团重点实验室；主持承担国家973计划、863计划、科技支撑计划、转基因生物品种选育重大专项、国家自然基金等各级各类项目42项；选育审定棉花新品种新垦棉1号和新垦棉2号；选育审定大豆品种新大豆12号和新大豆16号；《干旱区杂交棉亲本繁育及杂交种子质量控制》获2014年度兵团科技进步奖二等奖；收集保存棉花种质资源2500份；采集新疆大型真菌1200份；收集花生种质资源850份。发表研究论文82篇，其中Sci论文9篇；授权发明专利3项。