小麦育种创新团队目前共有科研人员10人，科研辅助人员3人。其中，研究员3人（其中1人享受国务院津贴）、副研究员5人、助理研究员2人，拥有博士学位1人、硕士学位5人，新疆农垦科学院青年拔尖人才人选1名、青年骨干人才1名。团队自成立以来选育审定冬、春小麦品种28个，累计推广面积2500万亩；积累和创制小麦种质资源3000多份；创建新疆拉面加工品质技术理论方法和新疆小麦品质与产量同步改良体系，开发了针对品质性状的CAPs和STS分子标记29个，发现了7个小麦籽粒硬度基因新突变类型；开发了7套强筋小麦HMW-GS基因的多重PCR检测体系，并构建了3套新疆拉面优质性状基因检测的多重PCR体系；团队承担国家及省部级重点项目30余项，发表论文40余篇，是兵团小麦研究的核心机构。
1.研究团队及特色优势
重点围绕小麦优异种质资源创制、评价、利用及小麦（包括冬小麦、春小麦、三系杂交小麦）新品种选育、高产栽培技术研究、小麦新品种的推广、开发以及小麦品质、病害和分子育种技术应用等开展研究工作。团队主要研究特色为三个方面：1）小麦新品种选育及高产栽培研究：主要围绕高产、优质、抗病、广适小麦品种选育、分子标记及全基因组选择育种技术、品种示范推广及高产栽培创建等开展研究工作；2）三系杂交小麦研究：主要围绕AL型三系杂交小麦选育方法、强优势组合筛选、亲本种质资源创制方法、恢复基因遗传规律和QTL定位及分子标记应用、亲本种子生产和杂交种纯度鉴定等开展研究工作，选育审定了新疆首个杂交小麦新品种“新冬43号”；3）小麦品质及新疆拉面加工品质研究：主要围绕小麦蛋白质、淀粉等重要品质性状及其基因型、营养品质，新疆特色面制食品—新疆拉面加工品质开展研究。目前，AL型三系杂交和新疆拉面加工品质研究处于国内领先水平。
2.研究方向
1）小麦种质资源创新与新品种选育：围绕优质、高产、抗病小麦重要目标性状，发掘和利用地方小麦及国内外优特异种质资源，开展基因发掘、分子机理解析，发展分子育种技术，创制优异新材料、选育小麦新品种。
2）小麦杂种优势利用研究及杂种小麦新品种选育：围绕亲本资源创制、强优势组合选育、繁制种技术研究和新品种示范推广，开展三系杂交小麦育种技术体系优化升级和杂交种的高产高效栽培技术研究，推动小麦杂交种在生产上的应用。
3）小麦品质研究及小麦品质改良技术研究与应用：以优质、专用市场需求为导向，开展小麦品种品质性状、营养品质性状及其遗传规律的研究；小麦品种品质性状早代预测技术的研究；新疆拉面加工品质改良技术与评价指标的研究。
4）小麦抗病研究及小麦抗病品种资源创制与育种应用：围绕新疆麦区主要病害白粉病和锈病开展表型和基因型鉴定分析，利用国内外抗病种质资源，开展抗病基因发掘、分子机理解析，创制抗病新种质并应用于品种选育。
5）高产栽培技术及新品种示范推广：针对新疆麦区生产的实际问题，结合区域发展战略需求，围绕提高小麦单产总体目标，开展耕作种植模式、肥料、灌水等栽培技术措施对小麦产量影响的研究；并针对新品种开展高产示范推广。
3.研究内容
方向一：小麦种质资源创新利用与新品种选育
针对新疆麦区丰富多样的生态环境下小麦生产的主要问题，发掘和利用地方小麦及国内外有特异种质资源含有的优良基因，通过分子育种结合常规育种技术，创制高产、优质、抗病、耐逆等有重大利用价值的品种资源，培育出适应新疆生态条件的高产、优质、多抗的小麦品种。
方向二：小麦杂种优势利用研究及杂种小麦新品种选育
围绕小麦杂交种具有较强的抗逆性，开展高产、优质、抗旱、耐盐碱等种质资源创制、鉴定及利用。针对强优势组合选育效率低，开展优势群划分等研究。构建混播制种技术体系、开展小麦杂交种半精量穴播高产栽培研究，推动小麦杂交种在生产上应用。
方向三：小麦品质及新疆拉面加工品质改良技术
以优质、专用市场需求为导向，开展小麦品种品质性状（蛋白质、淀粉、色泽、脂肪等）、营养品质性状（铁、锌、硒、维生素等）特性及其遗传规律的研究；针对小麦品种品质性状早代微量预测技术及优质新疆拉面加工品质评价指标开展研究并应用于育种实际，提高选育效率。
方向四：小麦抗病研究及小麦抗病品种资源创制与育种应用
针对新疆小麦生产中发生的主要病害白粉病和锈病，利用国内外抗病种质资源含有主效抗病基因，通过分子育种结合常规育种技术，创制抗病新种质并应用于培育优良抗病小麦新品种。
方向五：小麦高产栽培技术及新品种示范推广
针对新疆麦区生产的实际问题，结合区域发展战略需求，围绕提高小麦单产总体目标，开展品种耕种模式、肥料、灌水等栽培技术措施对小麦产量影响的研究；并对新品种开展小面积高产创建及示范推广。
