该中心承担农业部对西部地区农产品质量进行监督、检验、测试的机构，主要承担农产品质量、食品质量等检测、测试工作。
现拥有3000m²实验场所，配备有国内外先进测试仪器设备170台（件），固定资产3500万元，主要仪器有高效液相色谱仪、高效液相色谱-三重四级串联质谱仪、气相色谱-三重四级串联质谱仪、气相色谱仪、气-质联用仪、GPC-GC/MS、ICP、原子吸收分析仪、离子色谱仪、氨基酸自动分析仪、紫外/可见光分光光度计等设备仪器。可以完成食品、土壤、肥料、饲料、水质、大气的各项分析。 2018年中心已经达到能够承检528个产品，875个参数范围内的检测能力。编著了120万字的《饮料分析与检验》一书，主编了 《食品安全快速检测技术图解手册》，主持过国家自然科学基金项目2项，国家科技支撑计划1项，国家攻关项目2项，国家科技支撑项目子课题1项;主持兵团级课题2项，科技援疆计划1项，博士基金项目1项，参与横向科研课题多项，组织制定国家农业行业标准11个；制定新疆地方标准4项；获得兵团科技进步三等奖两项。
